El 31 de enero el Papa llegará a Kinshasa, capital congoleña. Allí será recibido en el Palacio de la Nación, la residencia oficial del presidente de la República. Más tarde, se encontrará con las autoridades, la Sociedad Civil y el Cuerpo Diplomático.
Al día siguiente, 1 de febrero, Francisco celebrará una Misa en el aeropuerto Ndolo y por la tarde visitará a las víctimas del este del país y se reunirá con los encargados de algunas asociaciones de caridad en la Nunciatura Apostólica.
El 2 de febrero, el Papa se reunirá con catequistas y jóvenes, para luego entrevistarse por la tarde en la Catedral Nuestra Señora del Congo con consagrados, diáconos, seminaristas y sacerdotes. A las 18:30 Francisco tendrá un encuentro privado con los miembros de la Compañía de Jesús en la Nunciatura Apostólica.
En su último día en el Congo, el Papa y los obispos se encontrarán en la Conferencia Episcopal y luego cogerá un avión hasta Sudán del Sur. En esta etapa del viaje estará acompañado por el Arzobispo de Canterbury y el representante de la Iglesia de Escocia. Lo primero que hará al llegar a Sudán será reunirse con el Presidente Salva Kiir Mayardit y los vicepresidentes de la República. Lo último esa jornada será un encuentro con las autoridades civiles y el cuerpo diplomático.
El 4 de febrero, Francisco estará en la Catedral de Santa Teresa con los obispos, diáconos, seminaristas, sacerdotes y consagrados. También se encontrará en privado con los jesuítas. Más tarde, estará con los desplazados internos del país, aquellas personas que han tenido que dejar su hogar pero se han mantenido dentro de las fronteras. Por último, habrá una oración ecuménica en el Mausoleo John Garang.
El último día del viaje apostólico, el Sumo Pontífice celebrará una Misa en el Mausoleo y, tras una ceremonia de despedida, regresará a Roma.