Os santos Paulo Miki (1564-1597), João de Goto e Diego Kisai são os primeiros jesuítas que deram a vida para imitar o Senhor crucificado no Japão. Miki provinha de uma família abastada perto de Osaka, e tornou-se cristão aquando da conversão da família. Aos 20 anos, inscreveu-se no seminário de Azuchi, dirigido pelos jesuítas, e dois anos depois entrou na Companhia. Falava muito bem e conseguiu atrair os budistas para a fé cristã. Faltavam-lhe apenas dois meses para a ordenação quando foi preso.
São Francisco Xavier tinha semeado Cristianismo no Japão a partir de 1549. Ele próprio converteu e baptizou um grande número de pagãos. Depois, províncias inteiras receberam a fé. Diz-se que em 1587 havia mais de 200.000 cristãos no Japão. Este crescimento causou reticências em algumas autoridades, que temiam que o cristianismo fosse o primeiro passo da Espanha para invadir o país.
Os missionários foram expulsos do Japão e a perseguição intensificou-se, terminando com a crucificação, perto de Nagasaki, dos jesuítas, franciscanos e terciários (26), em 1597. Os santos franciscanos são Pedro Bautista, Martín de Aguirre, Francisco Blanco, Francisco de San Miguel, espanhóis, Felipe de Jesús, nascido no México, ainda não ordenado, e Gonzalo García. Os restantes 17 mártires eram japoneses, vários catequistas e intérpretes. Da cruz, Pablo Miki perdoado os seus carrascos e proferiu um sermão convidando-os a seguir Cristo. com alegria.