Il 31 gennaio il Papa arriverà a Kinshasa, la capitale congolese. Lì sarà ricevuto al Palazzo della Nazione, la residenza ufficiale del Presidente della Repubblica. Successivamente, incontrerà le autorità, la società civile e il corpo diplomatico.
Il giorno seguente, 1° febbraio, Francesco celebrerà la Messa all'aeroporto di Ndolo e nel pomeriggio visiterà le vittime nell'est del Paese e incontrerà i responsabili delle associazioni caritative presso la Nunziatura Apostolica.
Il 2 febbraio, il Papa incontrerà i catechisti e i giovani, prima di incontrare i consacrati, i diaconi, i seminaristi e i sacerdoti nella Cattedrale di Nostra Signora del Congo nel pomeriggio. Alle 18:30 Francesco avrà un incontro privato con i membri della Compagnia di Gesù presso la Nunziatura Apostolica.
L'ultimo giorno di permanenza in Congo, il Papa e i vescovi si incontreranno presso la Conferenza episcopale e poi prenderanno l'aereo per il Sud Sudan. In questa tappa del viaggio sarà accompagnato dall'arcivescovo di Canterbury e dal rappresentante della Chiesa di Scozia. La prima cosa che farà al suo arrivo in Sudan sarà incontrare il Presidente Salva Kiir Mayardit e i Vicepresidenti della Repubblica. L'ultima cosa da fare quel giorno sarà un incontro con le autorità civili e il corpo diplomatico.
Il 4 febbraio, Francesco sarà nella Cattedrale di Santa Teresa con vescovi, diaconi, seminaristi, sacerdoti e consacrati. Incontrerà inoltre privatamente i gesuiti. Più tardi, sarà con gli sfollati interni del Paese, coloro che hanno dovuto lasciare le loro case ma sono rimasti all'interno dei confini. Infine, si terrà una preghiera ecumenica presso il Mausoleo di John Garang.
L'ultimo giorno del viaggio apostolico, il Papa celebrerà la Messa al Mausoleo e, dopo una cerimonia di commiato, tornerà a Roma.