Né à l'aube de l'an 1000 dans une famille modeste qui se consacrait à l'élevage, il s'occupa dans sa jeunesse du troupeau de son père, mais il se tourna rapidement vers les études pour être ordonné prêtre. Il demande à entrer au monastère de San Millán de la Cogolla, qui pratique la règle de saint Benoît. Après quelques années de vie monastique, il fut nommé prieur du monastère de Santa María de Cañas, qui dépendait de San Millán. Domingo le restaura et l'église fut consacrée.
Les moines de San Millán ont remarqué son travail et lui ont demandé d'être leur prieur. Dans le cadre de cette commission, le roi Don Garcia de Navarre lui demanda les biens de l'église, mais Domingo défendu le patrimoine de la maison et de l'église. Cette attitude lui vaut d'être renvoyé et enfermé en Castille, où il cherche l'appui du roi Ferdinand, qui le nomme abbé de Silos.
Santo Domingo de Silos a réformé cette monastèreEn détresse, il a constitué une grande bibliothèque qui a enrichi la culture, renouvelé et promu la vie spirituelle des bénédictins et de l'Église, jusqu'à sa mort en 1073.